土木工程系源于前身创建于1956年的交通部呼和浩特交通学校，2023年整合桥梁工程系、道路工程系和工程管理系筹备组建。我系历经60多年的积累和并入内蒙古大学20多年的本科教育发展，在师资队伍、科学研究、实践教学基地、实验设施等方面具有良好的积淀。

土木工程系现有“土木工程”一级学科、“公路环境工程”二级学科及“交通运输（交通基础设施工程方向）”专业学位3个硕士点，土木工程（自治区一流专业）、道路桥梁与渡河工程、工程管理、智能建造4个本科专业。土木工程系现有在校研究生150余人，本科学生1100余人。

土木工程系现有在职教职工专任教师55人，其中教授6人、副教授15人，博士学历教师35人，行政管理岗4人。目前共设置桥梁与隧道工程、道路工程、工程管理、智能建造、岩土与地下工程等5个教研室，负责土木工程、道路桥梁与渡河工程、工程管理、智能建造4个专业的教学工作。教师中现有教育部高等学校交通运输类专业教学指导委员会交通工程教学指导分委员会委员1人，“万人计划”青年拔尖人才1人，内蒙古自治区高等学校青年科技英才支持计划1人，荣获内蒙古自治区“草原英才”工程青年创新创业人才第一层次荣誉奖励1人。