2009年，内蒙古大学为支持运输工程系发展，把南校区b301、b303、b304划拨给我系作为实验室，建筑面积分别约为120m²、90m²、200m²。根据学科方向设有交通运输、现代物流、轨道交通三个教学实验室和内蒙古交通数据分析与可视化实验室一个科研实验室，主要从事交通运输工程硕士研究生、交通运输和物流管理本科、物流管理和城市轨道交通运营管理高职专业的教学和科研工作。

2009年建成交通运输实验室，设有交通仿真实验平台、交通规划实验平台，驾驶行为与人因分析系统实验平台，购入supermap gis、commuter、paramics、cube、uaf、ptv vision、synchro等国际先进交通规划、交通仿真相关软件系统，nc_200便携式交通流分析仪、激光测速仪、多功能交通调查仪、交通信号控制系统等设备。交通运输实验室设有计算机机房，学生可以在机房中学习ptv vision、cad、c语言、供应链管理软件等软件的操作。交通运输实验室可以完成交通流量、地点车速、距离、位置等相关的数据调查。

2009年建成现代物流实验室，经过十二五期的建设，物流实验室已基本完成预期目标。实验室拥有物流园区规划沙盘模型、供应一体化模型模型、区域配送沙盘模型自动立体化仓库系统、电子标签拣选系统、供应链管理系统、报关软件系统等，系统中包括自动搬运车（agv）、六自由度机器人、半自动打包机、塑料托盘、货架等物流基础设备。可以完成物流园区演示、供应一体化演示、区域配送流程演示、自动立体化仓库系统演示、拣选系统演示等教学科研项目。

2017年建成城市轨道交通实验室，实验室拥有列车调度指挥台、列车仿真系统、通讯仿真系统、信号仿真系统，拥有运行图/时刻表管理、车辆段、站务终端、信号核心平台系统软件，主要承担轨道交通相关课程的实践教学任务。

      2021年建成内蒙古交通数据分析与可视化实验室（科研实验室），实验室包括数据分析建模与仿真平台、数据可视化平台、中心实施平台等，实现交通数据的整合及共享，构建交通运输数据库。开展基于大数据的国际道路运输、智慧物流、城市群交通组织、轨道交通运营管理、城市公共交通规划设计、交通安全及应急管理等领域的研究。

交通运输实验室

现代物流实验室

轨道交通实验室

内蒙古交通数据分析与可视化实验室